早期的旗津是紅樹林的天堂：

台灣紅樹林計有三科六屬，其學名分別是海茄冬(鞭草科)、紅茄冬、細蕊紅樹、五梨跤、水筆仔(紅樹科)及使君子科的欖李；它具有異常根、乾生業及胎生果實三種特徵；它具有翠綠青蔥的葉子,花朵呈紅色,樹枝、樹幹都是暗紅色，一身的紅妝，獨具姿色；它的生長環境必須在海水流速緩慢、海浪平靜、潮水漲滿和退落間的地區；土質大多是腐植質及泥沙混合土,風力較弱之處；早期的旗津就是紅樹林的天堂，自從「過港隧道」通車、高雄港的擴建以及工業廢水的大量排入海域之後，嚴重的汙染水域，使紅樹林大量枯萎，破壞了紅樹林恬靜安逸的生態，扼殺了紅樹林獨特之美，將綠意盎然的空間破壞無遺；經過生態保育人員的大力鼓說，高雄市政府已開始重視紅樹林的自然景觀，目前已在積極進行的，就是保護旗津國中後面圍牆邊、馬路對面的「十三棵紅樹林」，並且加以美化,也想要在港區規劃一座「紅樹林帶」，希望能便利教學，並且藉此建立正確的生態觀念。